继续延续上一季的剧情，原来穆德受了骗，及时发觉错误后和史考莉串通好来骗政府高层，以潜入一个“作为一个普通FBI特别探员不该进入的地方”搜集需要的资料。本季发展越来越精彩，一些没有被完全改造的混血外...
继续延续上一季的剧情，原来穆德受了骗，及时发觉错误后和史考莉串通好来骗政府高层，以潜入一个“作为一个普通FBI特别探员不该进入的地方”搜集需要的资料。本季发展越来越精彩，一些没有被完全改造的混血外星人联合起来抵抗殖民阴谋。史考莉被绑架时子宫被移除，但今年却出现了她的孩子——艾蜜莉。今年制作小组甚至找了两位知名科幻小说家操笔，客串写出两集剧本。另外今年也有一集喜剧。整出X档案为了配合电影的上映，加入了一些角色及内容，“辛迪加”组织的阴谋越来越明显，穆德再一次接近事实的真相。穆德前女友的出现也对穆德与史考莉间的关系做出重大考验。该季结束于吸烟人烧毁了所有X档案卷宗。
摩里斯·切斯塔特,伊芙·哈洛,因加·施林曼,Tommy O'Brien,香农·贝里,Alessandro Pekin,Jean Zarzour,莱斯莉·米尔扎,Anita Alfke,Julia Koon,Camila Canó-Flaviá,Bethany Brown,Lauren Attadia,Ciara Mandel,Arash Ghorbani,彼得·马克·肯德尔,里特奇·科斯特,罗谢尔·阿耶斯,菲尔·纳多兹
汤姆·哈迪,皮尔斯·布鲁斯南,海伦·米伦,琼安·弗洛加特,帕迪·康斯戴恩,劳拉·普沃,曼蒂普·迪伦,亚历克斯·芬恩,丹尼尔·贝茨,丽莎·德万,杰夫·贝尔,贾思敏·乔布森,艾米莉·巴伯,安森·布恩,德里坦·卡斯特拉蒂,詹姆斯·费舍尔,Bradley Turner,Ellen Costa,Daniel De Bourg,Prince Marfo
斯蒂芬·阿梅尔,盖布瑞·马赫特,莱克斯·斯科特·戴维斯,乔什·麦克德米特,布莱恩·格林伯格,Troy Winbush,帕顿·奥斯瓦尔特,恩里克·克兰东尼,布莱恩·鲍姆加特纳,阿兹塔·加尼扎达,Rachelle Goulding,内森·维特,Carson A. Egan,玛姬·格蕾斯,维多利亚·嘉丝蒂,索非亚·佩尔纳斯,约翰·阿莫斯,马特·莱斯切尔,凯文·韦斯曼,爱丽丝·李
佩德罗·帕斯卡,贝拉·拉姆齐,加布里埃尔·鲁纳,卢蒂娜·卫斯理,凯特琳·德弗,伊莎贝拉·莫塞德,扬·马齐诺,阿里拉·巴勒,塔蒂·加布里埃,斯宾塞·洛德,丹尼·拉米雷斯,杰弗里·怀特,凯瑟琳·欧哈拉
艾洛蒂·袁
