曾经，一个高度发达的先进种族Ancient以地球为基地，几百万年前，不知什么原因，他们离开地球去了某地，在南极只留下一个前哨站。在Jack O'Neill将军用前哨站的一种Ancient武器消灭前来攻击地区的Goa'uld人的舰队之後，各国合作建立了南极联盟，为研究前哨站里的Ancient科技、促进国际合作与和平而共同努力。在研究过程中，他们发现了Ancient离开地球后所去的地方——飞马座星系。于是，为了发掘被埋没的历史、探索未知的世界，各国组建了亚特兰蒂斯探险团队，通过星际之门到达了几百万年前从地球飞走的亚特兰蒂斯城。
但不幸的是，地球人的到来惊醒了一群统治飞马座星系的怪物——Wraith，他们技术先进、体格健壮，性情粗野残暴，不讲信义，而且以人类为牲畜，吸人生命。一万年前他们打败了Ancient并迫使其逃回地球，而探险队也发现了一个惊人的事实：Wraith是Ancient试验的产物！为了对抗强大的Wraith，亚特兰蒂斯的小分队不得不探索飞马座星系诸星球，与飞马的原住民联系，试图找到抵御Wraith的方法，经历了一次次险象环生的旅程。
【PS】
《星际之门：亚特兰蒂斯》（英文Stargate Atlantis，简称SGA）是作为Stargate SG-1的一个衍生剧集开始的。SG-1本准备继续它的第7季和第二个故事片，但是当SG-1的第8季时，预定的电影变成了2集的季末终结篇"Lost City",Stargate Atlantis的设定也被移到了飞马星系。[10] 这样就可以让这两个节目在同一个虚构宇宙中并存，之后这两个节目甚至开始互相连接，基本上实现了观众想同时看两个节目的愿望。这个节目是由大多数的SG-1原班人马在同一个摄影棚里制作的。
Atlantis于2004年7月16日在（美国）Sci-Fi（科幻）频道初次上演，由en:Joe Flanigan和en:Torri Higginson主演，Rainbow Sun Francks、en:David Hewlett和en:Rachel Luttrell为配角。Hewlett与Higginson先前在SG-1中有角色。在Atlantis的第二季中，en:Paul McGillion和en:Jason Momoa（代替Francks）加入了常规演员的行列。该剧集已在第五季完结。
塔维南·阿努固布拉瑟,Franc Naruth Prateeppravameta,吉达蓬·坡提维赫,Acare Chompoopuntip Temtanamongkol,卡纳潘·佩泽坤,帕查差·司隶亚楠让
提图斯·维里沃,米密·罗杰斯,麦迪逊·林茨,Denise G. Sanchez,马克·阿特伯里,Patrick Brennan,Rafael Cabrera,杰西卡·卡马乔,Stephen A. Chang,布鲁斯·戴维森,大卫·丹曼,Anthony Gonzales,曼尼·斯特里茨,马克斯·马蒂尼,Jared Shipley,盖·威尔逊
瑞斯·达比,塔伊加·维迪提,弗莱德·阿米森,奈特·法松,莱斯莉·琼斯,萨姆森·卡约,维科·奥尔蒂斯,艾文·布莱纳,乔尔·弗莱,马修·马希尔,伊登·格雷斯·雷德菲尔德,戴维·法恩,罗里·金尼尔,克里斯蒂安·奈恩,康·奥尼尔,古兹·可汗,多米尼克·伯吉斯,Cerris Morgan-Moyer,乔纳森·梅迪纳,Benton Jennings,Samba Schutte,Nathan Foad
贝蒂·吉尔平,杰克·麦克道曼,伊利·亨利,Raphael Corkhill,山姆·米德,Roberto Mateos,达瑞·因戈尔夫松,桑德拉·库瑞,威洛·黑尔,Anna Lee Lawson,Rachel Winfree,Olivier Barrette,Starr Gilliard,Vic Zander,Nicholas Wagner,Ibrahim Renno,Paul Black,邦妮·阿伦斯,伊丽莎白·玛维尔,卡佳·赫尔伯斯,克里斯·迪亚曼托普洛斯,亚丽姗德拉·全,巴里·里维斯顿,阿什利·罗曼斯
约翰·卡拉辛斯基,维德尔·皮尔斯,约翰·胡热那克,艾比·考尼什,阿里·苏莱曼,迪纳·什瓦比,哈斯·塞雷曼,卡里姆·蔡因,埃曼纽尔·卢西尔·马丁内斯,约翰·艾德坡,弗朗西斯科·丹尼斯,詹迪·莫拉,克丽丝蒂娜·乌玛尼亚,戈兰·卡斯蒂克,梅纳·玛索德,大卫·诺罗纳,玛丽-乔西·克罗兹,蒂莫西·赫顿,丹尼尔·卡什