应该是从遥远的宇宙彼方K隆星来侵略地球的KERORO小队,在剧场版中却将地球从可怕的危机中拯救出来……这一次,KERORO军曹的面前出现了最新!最恶!最强的敌人!!
故事讲述冬树与KERORO小队一起去印加帝国的马丘比丘足迹参观,喜欢神秘事物的冬树当然是大为高兴,可是KERORO的脑袋里面装满了要侵略地球的事情。他们在那里因为迷路而发现了遗迹,后来因为突发状况而不得不从那里逃出。但在那时,冬树一瞬间看见了一位伫立在迷途中的少女。抱着对少女的不解之迷,冬树与KERORO回到了东京。不过这时,最强的敌人出现在了他们面前。样子和KERORO一模一样,但与KERORO不同天空対決戦tテンクウたい的是,他是要迅速且透彻地策划侵略地球的黑暗KERORO。他带领着部下CIBABA、DORURU、MIRURU一起在世界各国开始了侵略行动。而迎击这一切的KERORO小队的命运是?……
永冢拓马,Lynn,三川华月,集贝花,关根明良,大原沙耶香,加隈亚衣,宝龟克寿,子安武人
市之濑加那,矢野奖吾,高桥李依,根本京里,土岐隼一,八代拓
上田丽奈,石川界人,木村良平,下野纮,置鲇龙太郎,井上喜久子,户松遥,石田彰,内田夕夜
小林裕介,高桥李依
坂田将吾,茅野爱衣,东山奈央,土師亜文,雨宫天
藤寺美德,岛袋美由利,和泉风花,千叶翔也,山下诚一郎,安野希世乃,坂泰斗,游佐浩二,日笠阳子