1897年，大韩帝国时代动荡混沌，时有不同罪案发生，别巡检调查队四出调查，找寻破案的线索。
别巡检第2季的时代背景为1897年大韩帝国的国号宣布之后，比第1季还要迟些。高宗自俄罗斯回国后自称为皇帝，由此朝鲜便变为帝国，以阐明国家的自主性和独立性。并且施行了财政、教育、军事等几乎全方位的光武改革，令朝鲜向现代化迈进了一大步。因此这个时期应该是比第1季更为激动人心的时期，然而大韩帝国所追求的新价值，让国民看到的却是比任何时候都强大的同一与自主的混乱。
崔秀英,孔明,金成铃,金相镐,赵胤熙
咸恩静,徐俊英,朴允载,李歌领
沈利煐,宋昌义,崔贞允,郑英燮
姜河那,高旻示,金新绿,刘秀彬,裴那拉,洪华妍,吴敏爱,裴侑蓝,尹炳熙,李仲玉,柳演锡
金秀贤,玉泽演,张祐荣,裴秀智,咸恩静,李知恩,裴勇俊,金贤重
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