西元2199年,来自太阳系外的敌人加米拉斯帝国,为了挽救母星的危亡,开始侵略其他星球。地球军在与加米拉斯帝国军的交战中惨败,同时加米拉斯帝国军向地球发射大量含有放射能的游星炸弹。地球的抵抗力量越来越弱。本与加米拉斯为双子星球的伊斯坎达尔星球仗义相助,向地球发送了波动引擎和波动炮的设计图纸,并告知地球军本星球拥有清除放射能的设备“宇宙清洗器D”。在与欧洲、美洲失去联系的情况下,地球防卫军利用伊斯坎达尔星球提供的技术将沉睡于海底的大和号改造为宇宙战舰。大和号全体乘员踏上了取回“宇宙清洗器D”的漫漫征程。
浦和希,神谷浩史,西山宏太朗,石见舞菜香,坂田将吾,花江夏树,三浦魁,爱美,木村良平,岸尾大辅,伊濑茉莉也,小山刚志,增谷康纪,绪方惠美
间宫胡桃,上田丽奈,小原好美,永濑安奈
早见沙织,土屋神叶,青山吉能,细谷佳正
甲斐田幸,黑泽朋世,坂本真绫,石上静香,日笠阳子,小仓唯,南里侑香,竹达彩奈,山寺宏一,安野希世乃,日高法子,小林千晃,高垣彩阳,银河万丈,内田彩,天崎滉平,堀江瞬
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小林裕介,古川慎,市之濑加那,沼仓爱美,佐藤元,高桥花林,河西健吾,麦人,中村悠一,石田彰,小野贤章,铃木崚汰,坂本真绫,野岛健儿,游佐浩二