突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“ 使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下，并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的，却是是父亲冷酷地命令：驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。本已表示拒绝的真嗣，看到重伤的替补驾驶员绫波丽后，决定遵从父亲的命令。就这样，从未受过作战训练的真嗣，准备驾驶EVA初号机迎战使徒。
不断袭来的使徒，身份不明的绫波丽，从德国来的驾驶员惣流·明日香·兰格蕾，14岁的少年要面对远超自己能力的挑战。而碇元渡不动声色地观察一切，一个称为“人类补完计划”的神秘计划正在按照他的计划实现。
藤原夏海,古川慎
久保由利香 Yurika Kubo,粕谷大介
井藤智哉,稻垣好,田中美海,大野智敬,白石晴香,古川慎,白石凉子,吉野裕行,鈴村健一
龙星凉,齐藤秀翼,金城大和,盐野瑛久,今野鲇莉,丸山敦史,罗伯特·鲍德温,木下亚由美,出合正幸,千叶繁,饭丰万理江,森川智之,山下真司,纲本菜菜美,川冈大次郎,岛津健太郎,春田纯一,海老泽健次,藤泽玲花,涉江让二,大川透,菅生隆之,鹤冈聪,户松遥,水岛裕,折笠爱,松风雅也 Masaya Matsukaze,陶山章央,竹内良太
内田雄马,千叶翔也,内山昂辉,岛崎信长,丰永利行,河西健吾,冈本信彦,中村悠一,铃木崚汰,逢坂良太,齐藤壮马,浦和希,长谷川育美
关根明良,岛袋美由利,福原绫香,藤原夏海